La facciata incompiuta è costituita da blocchetti di travertino nella parte inferiore, da pietra del Subasio nella parte superiore, coronata da una cornice con protoni zoomorfe. Al centro il bel portale, riccamente ornato di fregi, è sormontato da ampia trifora con colonnine binate; ai lati due bifore sorrette da colonnine tortili.

L’interno, di suggestiva semplicità, è diviso in tre navate da robuste colonne con capitelli corinzi; a destra un pilastro serviva da sostegno al campanile.

La navata centrale è coperta da volta a botte, mentre le laterali da volte rampanti. Sopra la cripta, a cui si accede dalla navata sinistra, si erge il presbiterio sorretto da due colonne di cui una di recupero.

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Nella facciata si apre un bel portale polistilo della fine ‘300, ornato nella lunetta da un affresco in cattivo stato di conservazione. L’interno sottoposto a vari rifacimenti e restaurato nel ‘900, è ad una sola e luminosa navata.

Degli altari settecenteschi che ornavano le pareti della chiesa, rimangono bei paliotti in scagliola e significative pale di altare, alcune delle quali attribuite al bevanate Ascensidonio Spacca (XVI secolo).

Nel coro sono i resti di un importante ciclo di affreschi assegnati ad un maestro di cultura assisiate, legato ai primi giotteschi.

Nelle cappelle laterali sono conservate due sculture lignee della fine del ‘200: a sinistra la Madonna con il Bambino, a destra un bel Crocifisso ritenuto miracoloso. Sull’altare maggiore (sec. XVII) un’urna conserva il corpo del Beato Giacomo, mentre l’antico sarcofago è murato nella parete d’ingresso della chiesa.

Nell’attiguo convento è il chiostro, decorato con storie della vita del Beato Giacomo, da Giovanbattista Pacetti (sec. XVII). Nella sala capitolare, affreschi della metà del ‘300.

Scendendo per via del Gonfalone, dietro l’abside della chiesa dei Santi Domenico e Giacomo, si trovano cospicui resti di un edificio romano in opera mista, risalente probabilmente al II sec. d. C., che potrebbero essere delle strutture portuali.

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L’interno, ad una sola navata, è stato completamente rinnovato nel XVIII secolo; vi si ammirano dipinti di Dono Doni e Ascensidonio Spacca. Da una piccola porta a destra si accede a una cappella interna con affreschi risalenti al XVI secolo.

Accanto all’altare, in una cappella, una pietra sulla quale avrebbe posato i piedi San Francesco quando predicò agli uccelli a Piandarca. La seconda cappella a destra, forse opera di Galeazzo Alessi, conserva un bel tabernacolo del XV secolo; la cupoletta è adorna di terrecotte invetriate attribuite a Santi Buglioni.

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La facciata, incompiuta, presenta un rivestimento in travertino con lesene scanalate provenienti da un edificio romano. La chiesa, dopo varie vicissitudini, è stata adibita a cinema fino agli anni ‘70. Oggi rimangono solo le pareti laterali e la facciata. All’interno si conserva il mosaico di Aldo Ajò realizzato nel 1941 in occasione dell’inaugurazione del cinema cittadino, che rappresenta le tre città, Bevagna, Spello, Assisi, che si contendono la nascita del poeta latino Sesto Aurelio Properzio.

Mosaico di Aldo Ajò

All’ interno della chiesa si conserva ancora un mosaico in ceramica realizzato nel 1941, in occasione dell’inaugurazione del cinema cittadino. Il mosaico, di vaste dimensioni (2,70×2,47 m), rappresenta la disputa tra Bevagna, Spello e Assisi per i natali del poeta umbro Sesto Aurelio Properzio (I sec. d. C.). Le tre città sono più o meno nella loro posizione geografica e al centro è posta la raffigurazione del poeta latino, che guarda Bevagna, per ovvi doveri di committenza.
Il mosaico è opera dell’artista eugubino Aldo Ajò,  all’ epoca ceramista presso La Robbia di Gualdo Tadino, chiamato, oltre che per la sua fama, probabilmente anche per la parentela con la famiglia Mattoli di Bevagna.
Il pannello risulta dalla composizione di più parti. Lo sfondo è realizzato con piccole piastrelle in maiolica, mentre le figure sono formate da numerose formelle a rilievo, decorate con smalti sotto vetrina e con interventi di lustro e oro.

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La chiesa, oggi sconsacrata e usata come Auditorium, conserva un bel portale con un rilievo che raffigura la Madonna che allatta il Bambino.

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Nella tribuna e lungo le pareti vi sono frammenti di affreschi votivi del XIV secolo su più strati. Un recente restauro, reso possibile da Don Aldo Giovannelli, ha riportato alla luce una serie di absidiole, decorate nel corso del XVI secolo destinate agli altari e con soggetti dedicati alla Vergine.

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Il monastero, fondato nel 1271, conserva all’interno una suggestiva Scala Santa eseguita dal Providoni.

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